IEA-samarbeidet styres av Governing board, komitéer og arbeidsgrupper (se figur nedenfor). Det er etablert et sekretariat i Paris. Sekretariatet produserer en rekke analyser, og arrangerer/samordner konferenser.
En viktig del av IEA-samarbeidet retter seg mot forskning og teknologiutvikling gjennom selvstendige program, såkalte "Technology Collaboration Programs (TCP)". Norge deltar i flere av disse programmene. Den norske deltagelsen er beskrevet her.
